數控線切割機床的床坐標系又稱之為機械坐標系，它是機床上固有的坐標系。機床原點又稱為機械原點，它是機床坐標系的原點，它位于各坐標軸的正向最大極限處。這個點的位置是由機床生產商確定的，是數控線切割機床進行加工運動的基準點，也是其檢測的基準。

數控線切割機床坐標系的定義與其他數控機床一樣按照國家標準。電極絲相對于靜止的工件而運動。標準坐標系采用右手直角笛卡兒坐標系。數控線切割機床坐標系也可按面對工作臺的左右方向為X軸，右邊為X軸的正向。面對工作臺的前后方向為Y軸，前向為Y軸的正向當標準。由于在整個切割加工過程中，電極絲始終垂直貫穿工件，不需要描述電極絲相對于工件在垂直方向的運動，故Z坐標省去不用。

有些數控線切割機床在進行錐度切割時，上絲架上的十字滑板可做前后、左右移動，這是平行于X軸和Y軸的另一組坐標軸，稱為附加坐標軸。其中平行于X軸的左右移動軸為U坐標軸，平行于Y軸的前后移動軸為V坐標軸。X, Y,U,V四個坐標運動的有機配合，即四軸聯動控制，就能加工出有錐度和上下異形截面形狀的零件。

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